11．为什么物理学的基本方程都具有时间反演不变性？
12．为什么绝对零度不可达到？
13．为什么热水比冷水冻结快些（Erasto Mpemba问题）？
14．运动物体的温度会改变吗？
15．开放系统的熵具有什么物理意义？
16．湍流形成的机理是什么？
17．地球磁场极性颠倒的原因是什么？
18．南极空洞是怎么形成的？
19．生物体内有核反应吗？
20．地球外有智慧生物吗？
21．地震前的地光是怎么形成的？
22．为什么闪电多‘之’字形少球形？
23．自然界是否存在七种对称性晶体？
24．能否解决强关联多电子系统的基态和元激发问题？
25．能否解决低维凝聚态物理新现象的理论问题？
32．可控轻核聚变能否实现？
33．激光热核反应的点火条件（劳森判据）能否达到？
34．常温核聚变能否实现？
35．冷核聚变能否实现？
36．薛定谔的猫是死还是活？
37．EPR之谜能否解决？
38．量子混沌确实存在吗？
39．高温超导的微观机理是什么？
40．可否发现室温超导体？
41．最后一个超重元素的质子数是多少？
42．热中子辐射俘获疑问的实质是什么？
43．原子核磁矩能否准确计算出来？
44．Gamow-Teller巨共振问题gA（核内核子）!=gA（自由核子）能否解决？
45．奇异电子峰是怎样形成的？
46．EMC效应能否解决？
47．质子自旋危机能否解决？
48．电子与核散射中，纵向响应形状因子问题能否解决？
49．有限核的结合能与能极能否一一准确算出来？
50．夸克－胶子等离子体（QGP）物质态是否真的存在？
51．双生子佯谬能否解决？
52．穿洞佯谬能否解决？
53．滑落佯谬能否解决？
54．柔绳佯谬能否解决？
55．直角杠杆佯谬能否解决？
56．静止长度上限佯谬能否解决？
57．运动物体视在形象佯谬能否解决？
58．长度缩短的应力效应佯谬能否解决？
59．超光速佯谬能否解决？
60．快子佯谬能否解决？
61．奥本海默佯谬能否解决？
62．奥伯斯佯谬能否解决？
63．宇宙种子磁场的来历是什么？
64．太阳中微子之谜能否解决？
65．中微子有无静止质量？
66．有无中微子振荡？
67．类星体的能源是什么？
68．黑洞何时可以露真容？
69．磁单极是否存在？
70．Higgs粒子是否存在？
71．质量的起源是什么？
72．真正的对称自发破损的机理是什么？
73．自由夸克能否直接在实验中被发现？
74．有无胶子球存在？
75．轴子，畴壁能否找到？
76．存在第四代基本粒子吗？
77．CP不守恒难题只能在中性K介子衰变中见到吗？
78．引起CP对称性破坏的力是什么？
79．e-u-t之谜何时能解开？
80．亚夸克结构仅仅是推测吗？
81．质子的寿命有多长？
82．电子有无结构？
83．光子有无结构？
84．真空的本质是什么？
85．有无奇异物质存在？
86．C，Ψ物理中的ρπ疑难能否解决？
87．是否存在中性，稳性，质量至少大于40GeV的超对称粒子？
88．究竟有无超弦？
89．虫洞究竟有没有？
90．时间机器能造出来吗？
91．引力能否用量子理论加以描述？
92．能否将引力和其他几种基本力统一起来？
93．自然界手征不对称起源的关键是什么？
94．宇宙会一直膨胀下去吗？
95．宇宙大爆炸的量子起源是什么？
96．大爆炸之前可能存在什么？
97．我们的宇宙是否有兄弟姐妹？