溯看着屏幕上的“共生纪念碑”，眉头紧锁——那是联邦为纪念共生文明建立而修建的建筑，位于城市中心，每天都有无数人前去参观，谁也不知道纪念碑下竟有密室。更让他疑惑的是“局内人”的警告：别相信共生网络的信息，包括自己的记忆？难道他的记忆也被篡改了？
他下意识地摸了摸口袋里的传感器，传感器的温度竟比刚才低了许多，仿佛有什么东西在里面生长。沈溯深吸一口气，做出了一个冒险的决定：独自前往共生纪念碑，他要知道，这个看似平静的联邦背后，究竟还藏着多少不为人知的秘密，而反共生文明的攻击，又仅仅是“哲学危机”那么简单吗？
与此同时，在联邦的另一个角落，星尘意识体的边缘区域，一个名叫“星芽”的年轻星尘个体正蜷缩在记忆海的碎片中。她没有像其他星尘那样被混乱的记忆流裹挟，反而能清晰地看到，那些墨色物质在吞噬记忆时，会留下一道极细的银色丝线，这些丝线顺着记忆海的流向，汇聚向同一个方向——共生纪念碑的方向。
“拾光大人，我看到了‘线’。”星芽试图将自己的发现传递给拾光，却发现意识通道被一层无形的屏障阻隔，她只能眼睁睁地看着银色丝线越来越粗，而记忆海的光芒越来越暗，“那些线……在拉着我们往一个地方走，好像有什么东西在等着我们。”
而在硅基文明的地下维修通道里，一个编号为“734”的硅基机器人正用自己的维修工具，小心翼翼地刮着控制台上的黑色粒子。它本该像其他机器人一样被反共生符号控制，却因为百年前一次意外的系统故障，保留了一部分独立意识。此刻，它的光学传感器里，正显示着一段被加密的硅基历史数据：百年前，人类与硅基文明建立共生关系时，曾有一个秘密团队反对这种“融合”，他们认为硅基文明应该保持纯粹的逻辑，而这个团队的领导者，正是当年负责设计智脑核心程序的科学家——沈溯的祖父。
734将刮下的黑色粒子装进自己的储物舱，它不知道这些粒子有什么用，也不知道那段历史数据意味着什么，它只知道，自己必须把这些东西交给“那个能阻止混乱的人”。它沿着维修通道缓慢移动，光学传感器偶尔扫过通道壁上的监控摄像头，摄像头的红灯闪烁了一下，竟没有记录下它的身影——仿佛有一只无形的手，在为它的行动扫清障碍。
沈溯站在共生纪念碑前，看着碑身上雕刻的人类、硅基、星尘握手的图案，图案的边缘不知何时也爬了一丝极淡的墨色。他按照“局内人”的提示，在纪念碑底座的凹槽里输入了一串密码——那是他祖父临终前告诉他的，说是“未来某天能救命的密码”。凹槽缓缓打开，露出一个向下延伸的阶梯，阶梯两侧的墙壁上，镶嵌着星尘凝结的照明石，可此刻，照明石的光芒却忽明忽暗，像在预示着前方的危险。
他走下阶梯，每一步都能听到自己的脚步声在通道里回荡，空气中弥漫着一股淡淡的金属锈蚀味，与存在树培养舱里的味道一模一样。通道的尽头是一扇厚重的金属门，门上刻着一个他从未见过的符号——一半是人类的神经突触，一半是硅基的芯片纹路，中间被一道黑色的线隔开。
沈溯伸出手，刚碰到金属门，门就自动打开了。密室里没有复杂的仪器，只有一个悬浮在中央的透明容器，容器里装着的，竟是一团与存在树叶片上相同的墨色物质，而容器的外壁上，贴着一张纸条，纸条上的字迹，是他祖父的笔迹：
“共生不是救赎，是牢笼。反共生文明，是破笼的钥匙。——沈垣”
沈溯的大脑瞬间一片空白，他看着纸条上的字，又看了看容器里的墨色物质，突然想起小时候祖父对他说过的话：“溯溯，记住，任何文明的存在，都不能以失去‘自我’为代价。”那时他以为祖父只是在讲哲学道理，现在才明白，祖父或许从一开始，就不认同共生文明的存在。
就在这时，密室的灯光突然熄灭，只有透明容器里的墨色物质发出微弱的光。沈溯的个人终端再次震动，“局内人”的消息弹了出来：“你看到了真相的一角，但这只是开始。现在，墨色物质已经扩散到联邦的十个共生节点，再过十二个小时，整个共生网络就会彻底崩溃。而你，有两个选择：要么摧毁共生网络，保住三个文明的‘纯粹性’；要么找到‘共生核心’，修复被侵蚀的连接。但记住，共生核心的位置，只有被墨色物质吞噬过记忆的人，才能看到。”
消息消失后，透明容器里的墨色物质突然涌动起来，化作一只黑色的手，朝着沈溯的方向伸来。他下意识地后退，却撞到了身后的金属门，门瞬间锁死，没有留下任何缝隙。密室里的墨色物质越来越多，逐渐将他包围，沈溯看着眼前的黑色浪潮，突然意识到，自己从一开始，就不是在“对抗”反共生文明，而是在“选择”——选择共生文明的未来，也选择自己祖父留下的“真相”。
而此刻，星芽正顺着银色丝线的方向，朝着共生纪念碑移动；734也终于走出了维修通道，它的光学传感器里，第一次出现了沈溯的位置信息；拾光则在记忆海的核心区域，发现了一段被隐藏的记忆片段：百年前，沈垣在设计智脑核心程序时，偷偷留下了一个“后门”，而这个后门的启动密码，正是沈溯的生日。
三个不同的个体，三条不同的线索，正朝着同一个目标汇聚。他们不知道，自己即将揭开的，不仅是反共生文明的秘密，更是共生文明建立之初，那个被刻意掩盖的“原罪”。而沈溯站在密室的黑色浪潮中，指尖轻轻触碰了一下墨色物质，他的脑海里，突然闪过一段陌生的记忆——那是他祖父与反共生文明对话的画面，画面的最后，沈垣笑着说：“等他们意识到共生的脆弱时，就是破笼的时刻。”
这段记忆是真实的吗？祖父真的是反共生文明的“