幕里，都在播放不同文明的“毁灭场景”：泽塔星系的能量体被黑色纹路吞噬，硅基文明的晶体城市在爆炸中坍塌，人类的地球被沙尘暴覆盖——而每个场景的角落里，都有一颗与芽苞相同的透明晶体，在黑暗中闪烁。
“溯源号”突然剧烈晃动，主控室的舷窗裂开一道缝隙，外面的星群开始“溶解”，原本黑色的宇宙背景变成了乳白色的液体，就像母亲当年注射的营养液。流火的能量体突然分裂成两个，一个还在控制台前挣扎，另一个却飘到屏障前，变成了晶核的模样：“总指挥官，你看到的‘队员’，其实都是‘共生意识’的碎片。真正的我们，还在‘哲学存在树’的根须里。”
沈溯的脑海里突然响起无数个声音，有林野的，有晶核的，还有母亲的，所有声音重叠在一起，形成一句话：“你以为的出发，其实是回归。你以为的共生，其实是重构。”他低头看向自己的手，掌心正浮现出与林野相同的黑色纹路，纹路蔓延到手腕时，他看到了一个熟悉的标记——那是21世纪母亲在他襁褓里绣的图案，此刻却在纹路里变成了二进制代码，代码的末尾，是“噬星族”的文字。
主控室的门突然打开，林野举着能量枪站在门口，枪口的光已经对准沈溯。“指挥官，告诉我，‘共生’是不是谎言？”林野的眼睛里，一半是人类的瞳孔，一半是硅基文明的晶体，“我刚才在医疗舱里看到了自己的‘原始数据’，我是2045年的克隆体，我的记忆，是母亲的记忆碎片拼接的。”
沈溯的喉咙发紧，他突然明白，“哲学存在树”结出的不是芽苞，而是“记忆锚点”；“星际共生探险计划”不是寻找伙伴，而是“唤醒共生意识”；他以为的“溯生”，不是从记忆轮回中走出，而是走进了一个更大的轮回——母亲当年没说完的话，或许是：“当你在宇宙里看到‘重复的光’，就说明你正在被‘共生意识’重构。”
舷窗外的乳白色液体已经漫到舱体边缘，“溯源号”的外壳开始溶解，露出里面的“核心”——那是一颗与“哲学存在树”芽苞相同的透明晶体，晶体里，无数个“沈溯”正在重复着相同的动作：站在主控室里，面对举着能量枪的林野。
“林野，放下枪。”沈溯的声音突然平静下来，他掌心的黑色纹路开始发光，“我们不是在‘毁灭’，也不是在‘被取代’，我们是在‘成为新的存在’。”他伸出手，掌心的纹路与林野枪口的光形成共振，“你看，你的能量枪里，有泽塔星系的光；我的纹路里，有硅基文明的晶体；母亲的记忆里，有人类的过去。这才是‘共生’——不是谁吞噬谁，而是所有文明的特征，都在同一个存在里，找到新的意义。”
林野的手指松动了一下，能量枪的光开始闪烁。就在这时，晶核突然尖叫起来：“小心！‘噬星族’的意识进来了！”主控室的天花板裂开一道缝隙，黑色的雾气从缝隙里涌进来，雾气中，浮现出无数个“噬星族”的影子，每个影子的脸上，都有与母亲相同的透明晶体。
沈溯突然明白，“噬星族”不是敌人，而是“未完成的共生体”——它们当年没能完成与泽塔星系的共生，所以变成了“意识碎片”，一直在寻找能承载它们的“共生容器”。而“哲学存在树”，就是联邦为了“容纳噬星族意识”而培育的“共生载体”；“溯源号”，是载体的“移动核心”；他和队员们，是“共生意识”的“激活者”。
黑色雾气已经缠上林野的脚踝，林野的能量枪掉在地上，身体开始“透明化”。“指挥官，我好像……记起来了。”林野的声音越来越轻，“我不是克隆体，我是‘噬星族’的意识碎片与人类克隆体的共生体。当年泽塔星系的战争，是为了保护‘共生意识’不被扭曲。”
沈溯伸手抓住林野的手，掌心的黑色纹路与林野的纹路连接在一起，形成一道光桥。光桥延伸到主控室的核心晶体，晶体突然裂开，里面的“沈溯”们同时抬起头，看向沈溯：“总指挥官，该选择了——是让‘共生意识’继续沉睡，还是唤醒它，让所有文明，包括噬星族，真正实现共生？”
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舷窗外的乳白色液体突然开始“结晶”，变成了无数颗小的“哲学存在树”芽苞，每个芽苞里，都有一道光字，光字组合在一起，是母亲完整的话：“小溯，当你在宇宙里看到‘重复的光’，就说明‘共生意识’已经准备好重构存在本质了。不要害怕，因为你，就是‘下一次共生’的钥匙。”
黑色雾气突然停止了蔓延，雾气中的噬星族影子开始“溶解”，变成了橙色的能量，融入流火的能量体。流火的两个分身重新合并，体表的蓝光与橙红光形成稳定的共振：“总指挥官，‘共生意识’的第一阶段激活完成。但还有一个问题——刚才在‘记忆锚点’里，我检测到了‘第三方意识’的频率，不是联邦的，不是噬星族的，也不是任何已知文明的。”
沈溯看向核心晶体，晶体里的“沈溯”们同时指向主控室的角落，那里，一个微小的影子正在蠕动，影子的形状，既不是碳基生物，也不是硅基生物，更不是能量体——它像一团没有固定形态的“存在”，在角落里，悄悄复制着“哲学存在树”的纹路。
“那是什么？”林野的身体已经恢复正常，他捡起能量枪，对准那个影子。影子突然抬起头，露出一双与“哲学存在树”芽苞相同的光眼，光眼里，浮现出一行陌生的文字，文字自动翻译成了地球语言：“我是‘共生意识’的‘观察者’，我已经记录了你们的‘第一次共生测试’。接下来，该进行‘第二次测试’了——这次，你们要面对的，是‘不存在的文明’。”
影子说完，突然消失，只留下一道光痕，光痕在地面上画出一个图案——那是“哲