，王公大概已经死了吧！”立刻去见他的哥哥周抚说：“王公已经死了，哥哥为什么还要和钱凤一起做乱贼！”众人听后都很惊愕。
丙申日，王含等人烧毁营帐连夜逃跑。丁酉日，明帝返回宫中，大赦天下，只有王敦的党羽不被赦免。随后命令庾亮督察苏峻等人到吴兴追击沈充，温峤督察刘遐等人到江宁追击王含、钱凤，分别命令众将追击他们的党羽。刘遐的士兵多有掳掠行为，温峤责备他说：“天道帮助顺应天意的人，所以王含被剿灭，你怎么能趁乱作乱呢！”刘遐惶恐地道歉。
王含想逃奔荆州，王应说：“不如去江州。”王含说：“大将军平时和江州刺史的关系怎么样，却想要去投奔他？”王应说：“这正是应该去的原因。江州刺史在别人强盛的时候，能坚持不同的意见，这不是常人能比得上的，现在看到我们处境困厄，必定会有怜悯之心。荆州刺史遵守条文，怎么会做出意料之外的事呢！”可王含不听，于是逃奔荆州。王舒派兵迎接他们，把王含父子沉入江中。王彬听说王应要来，就秘密准备船只等候；但王应没来，王彬深感遗憾。钱凤逃到阖庐洲，周光杀了他，随后带着钱凤的人头到朝廷赎罪。沈充逃跑时迷了路，误进了过去的部将吴儒家里。吴儒引诱沈充进入夹墙中，趁机笑着对沈充说：“我要得到三千户侯的爵位了！”沈充说：“你如果讲道义保全我，我家必定会重重报答你。如果为了利益杀我，我死了，你也会被灭族。”吴儒最终杀了沈充，把他的首级送到建康。至此，王敦的党羽全部被平定。沈充的儿子沈劲应当被处死，同乡人钱举把他藏了起来，这才得以幸免；后来沈劲最终灭了吴氏家族。
随后，有关部门挖开王敦的坟墓，挖出尸体，烧毁他的衣帽，让尸体跪着斩首。又把他的首级和沈充的首级一起悬挂在南桁。郗鉴对明帝说：“前朝诛杀杨骏等人，都是先施加官府的刑罚，然后听凭私人安葬。我认为王法施加于上，私人道义实行于下，应该听凭王敦的家人收葬，从道义上来说更为弘大。”明帝同意了。司徒王导等人都因讨伐王敦的功劳受到封赏。
周抚和邓岳一起逃亡，周光想资助他的哥哥而抓住邓岳。周抚发怒说：“我和邓岳一起逃亡，为什么不先杀我！”恰逢邓岳到来，周抚出门远远地对他说：“为什么不赶快离开！现在亲骨肉尚且想互相危害，何况是别人呢！”邓岳掉转船头逃跑，和周抚一起进入西阳蛮人中。第二年，诏令赦免王敦的党羽，周抚、邓岳出来自首，得以免死但被禁锢。
前吴内史张茂的妻子陆氏，拿出全部家产，率领张茂的部曲作为先锋讨伐沈充，为她的丈夫报仇。沈充失败后，陆氏到朝廷上书，为张茂未能打败沈充而谢罪；诏令追赠张茂为太仆。
有关部门上奏说：“王彬等人是王敦的亲族，都应当被除去名籍。”诏令说：“司徒王导以大义灭亲，尚且要宽恕他百代子孙，何况王彬等人都是王导的近亲呢！”全部不加追究。
诏令说：“王敦的主要属官除去名籍，僚属被禁锢。”温峤上疏说：“王敦刚愎自用、没有仁爱之心，忍心施行杀戮，朝廷不能控制他，骨肉亲人不能劝谏他；在他朝中任职的人，常常害怕危亡，所以人们闭口不言，在路上相遇只用眼神示意，实在是贤人君子走投无路、顺应时势隐藏自己的时候。推究他们的私心，哪里有空闲安享太平呢！像陆玩、刘胤、郭璞这类人常和我说起，我全都知道。如果他们确实帮助引导王敦做凶恶悖逆的事，自然应当用典刑惩处；如果是被冤枉陷入奸党之中，我认为应该施加宽恕。我因为陆玩等人的忠诚，让圣上知道了，应当受到和叛贼相同的责罚；如果沉默不言，实在是辜负了他们的心意，希望陛下仁慈圣明地裁决！”郗鉴认为先王确立君臣的教化，可贵之处在于坚守节操为义而死。王敦的僚属，虽然多被逼迫，但进不能阻止他的叛逆阴谋，退不能脱身远远逃走，按照前代的教训，应该加以道义上的责罚。明帝最终听从了温峤的建议。
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冬季，十月，任命司徒王导为太保，仍兼任司徒，赐予特殊的礼遇；西阳王司马羕兼任太尉；应詹为江州刺史；刘遐为徐州刺史，代替王邃镇守淮阴；苏峻为历阳内史；加授庾亮为护军将军，温峤为前将军。王导坚决推辞，不接受任命。应詹到江州后，官吏百姓还未安定，他就加以安抚关怀，众人没有不心悦诚服的。
十二月，凉州将领辛晏占据枹罕，拒不服从命令，张骏准备讨伐他。从事刘庆劝谏说：“称霸天下的军队，必须要天时、人事相契合，然后才能行动。辛晏凶恶狂妄、残忍无情，他的灭亡是必然的；但为什么要在饥荒之年大举出兵，在严寒之时攻打城池呢！”张骏于是停止了行动。张骏派遣参军王骘到前赵聘问，前赵主刘曜对他说：“你们州真诚地与我们和好，你能保证做到吗？”王骘说：“不能。”侍中徐邈说：“你前来缔结友好关系，却说出不能保证的话，为什么呢？”王骘说：“齐桓公在贯泽会盟时，心怀戒惧，诸侯不请自来；到葵丘会盟时，自满自大，结果有九个诸侯背叛。赵国的教化，如果能一直像今天这样，自然可以保证和好；如果政治教化衰败，连身边的变化都不能察觉，又何况我们偏远的凉州呢！”刘曜说：“这是凉州的君子啊，选择使者可以说是选对人了！”于是以厚礼相待，送他回去。
这一年，代王贺傉开始亲自处理国家政事，因各部大多没有臣服，就在东木根山筑城，迁徙到那里居住。
公元325年
春季，二月，张骏接到晋元帝去世的消息，大规模哭吊三天。恰逢有黄龙出现在嘉泉，汜祎等人请求更改年号以彰显吉祥，张骏没有同意。辛晏献出枹罕投降，张骏重新收复了黄河以南的土地。
随后，朝廷追赠已故的谯王司马承、甘卓、戴渊、周顗、虞望、郭璞、王澄等人官职。周札的旧部下为周札鸣冤，尚书卞壸议